MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015183	TCG	2	6	182856	182861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291620
3502	NC_015183	CG	3	6	182890	182895	0 %	0 %	50 %	50 %	325291620
3503	NC_015183	GTC	2	6	182942	182947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291620
3504	NC_015183	TCC	2	6	183057	183062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291620
3505	NC_015183	AGC	2	6	183063	183068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291620
3506	NC_015183	GGTG	2	8	183085	183092	0 %	25 %	75 %	0 %	325291620
3507	NC_015183	GGTC	2	8	183101	183108	0 %	25 %	50 %	25 %	325291620
3508	NC_015183	GCCC	2	8	183118	183125	0 %	0 %	25 %	75 %	325291620
3509	NC_015183	CGC	2	6	183153	183158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291620
3510	NC_015183	GC	3	6	183225	183230	0 %	0 %	50 %	50 %	325291620
3511	NC_015183	CGC	2	6	183256	183261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291620
3512	NC_015183	GGC	2	6	183281	183286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291620
3513	NC_015183	GCGA	2	8	183333	183340	25 %	0 %	50 %	25 %	325291620
3514	NC_015183	CGC	2	6	183393	183398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291620
3515	NC_015183	ACAT	2	8	183456	183463	50 %	25 %	0 %	25 %	325291620
3516	NC_015183	CGT	2	6	183489	183494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291621
3517	NC_015183	GGCA	2	8	183499	183506	25 %	0 %	50 %	25 %	325291621
3518	NC_015183	CG	3	6	183545	183550	0 %	0 %	50 %	50 %	325291621
3519	NC_015183	GTT	2	6	183561	183566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291621
3520	NC_015183	ATG	2	6	183613	183618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291621
3521	NC_015183	CAG	3	9	183645	183653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291621
3522	NC_015183	CCG	2	6	183661	183666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291621
3523	NC_015183	ATG	2	6	183685	183690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291621
3524	NC_015183	CGT	2	6	183693	183698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291621
3525	NC_015183	AGG	2	6	183743	183748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291621
3526	NC_015183	T	6	6	183791	183796	0 %	100 %	0 %	0 %	325291621
3527	NC_015183	TGT	2	6	183801	183806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291621
3528	NC_015183	ATCC	2	8	183829	183836	25 %	25 %	0 %	50 %	325291621
3529	NC_015183	GC	3	6	183857	183862	0 %	0 %	50 %	50 %	325291621
3530	NC_015183	AAG	2	6	183900	183905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291621
3531	NC_015183	AGCGGC	2	12	183928	183939	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325291621
3532	NC_015183	TGT	2	6	183948	183953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291621
3533	NC_015183	CTT	2	6	183999	184004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291621
3534	NC_015183	TCCTC	2	10	184077	184086	0 %	40 %	0 %	60 %	325291622
3535	NC_015183	GAA	2	6	184097	184102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291622
3536	NC_015183	TTTC	2	8	184123	184130	0 %	75 %	0 %	25 %	325291622
3537	NC_015183	T	6	6	184159	184164	0 %	100 %	0 %	0 %	325291622
3538	NC_015183	AAG	2	6	184175	184180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291622
3539	NC_015183	CTT	2	6	184250	184255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291622
3540	NC_015183	GGT	2	6	184325	184330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291622
3541	NC_015183	CACCGC	2	12	184351	184362	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325291622
3542	NC_015183	AAG	2	6	184478	184483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291622
3543	NC_015183	ACC	2	6	184488	184493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291622
3544	NC_015183	TTTCC	2	10	184496	184505	0 %	60 %	0 %	40 %	325291622
3545	NC_015183	AGAA	2	8	184641	184648	75 %	0 %	25 %	0 %	325291623
3546	NC_015183	ACG	2	6	184711	184716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291623
3547	NC_015183	GCC	2	6	184730	184735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291623
3548	NC_015183	CGAGG	2	10	184820	184829	20 %	0 %	60 %	20 %	325291623
3549	NC_015183	GAT	2	6	184844	184849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291623
3550	NC_015183	GC	3	6	184851	184856	0 %	0 %	50 %	50 %	325291623
3551	NC_015183	GCT	2	6	184937	184942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291623
3552	NC_015183	CAC	2	6	184952	184957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291623
3553	NC_015183	GGC	2	6	184979	184984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291623
3554	NC_015183	GCCG	2	8	185047	185054	0 %	0 %	50 %	50 %	325291623
3555	NC_015183	CGG	2	6	185080	185085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291623
3556	NC_015183	A	6	6	185116	185121	100 %	0 %	0 %	0 %	325291623
3557	NC_015183	CCG	2	6	185134	185139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291623
3558	NC_015183	CTGC	2	8	185382	185389	0 %	25 %	25 %	50 %	325291624
3559	NC_015183	CTT	2	6	185428	185433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291624
3560	NC_015183	CCG	3	9	185448	185456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291624
3561	NC_015183	CGC	2	6	185463	185468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291624
3562	NC_015183	GCC	2	6	185560	185565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291624
3563	NC_015183	CACG	2	8	185619	185626	25 %	0 %	25 %	50 %	325291624
3564	NC_015183	GGA	2	6	185632	185637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291624
3565	NC_015183	GCC	2	6	185666	185671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291624
3566	NC_015183	AGC	3	9	185681	185689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291624
3567	NC_015183	GGC	2	6	185773	185778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291624
3568	NC_015183	CTG	2	6	185779	185784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291624
3569	NC_015183	TCG	2	6	185873	185878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291624
3570	NC_015183	GGT	2	6	185893	185898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291624
3571	NC_015183	GCG	2	6	185927	185932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291624
3572	NC_015183	CAA	2	6	186069	186074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291624
3573	NC_015183	CGC	2	6	186163	186168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291624
3574	NC_015183	ACCA	2	8	186169	186176	50 %	0 %	0 %	50 %	325291624
3575	NC_015183	CCA	3	9	186174	186182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291624
3576	NC_015183	GCC	2	6	186334	186339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291625
3577	NC_015183	GC	3	6	186371	186376	0 %	0 %	50 %	50 %	325291625
3578	NC_015183	GCC	2	6	186399	186404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291625
3579	NC_015183	ACG	2	6	186417	186422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291625
3580	NC_015183	TGC	2	6	186433	186438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291625
3581	NC_015183	GCG	2	6	186454	186459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291625
3582	NC_015183	CGC	2	6	186473	186478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291625
3583	NC_015183	AAAGCG	2	12	186604	186615	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325291625
3584	NC_015183	CGG	2	6	186697	186702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291625
3585	NC_015183	GCCCGC	2	12	186730	186741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291625
3586	NC_015183	CG	3	6	186807	186812	0 %	0 %	50 %	50 %	325291625
3587	NC_015183	GCC	2	6	186836	186841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291625
3588	NC_015183	ACG	2	6	186918	186923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291625
3589	NC_015183	CG	3	6	186922	186927	0 %	0 %	50 %	50 %	325291625
3590	NC_015183	T	6	6	186941	186946	0 %	100 %	0 %	0 %	325291625
3591	NC_015183	GTC	3	9	186971	186979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291625
3592	NC_015183	TGA	2	6	187018	187023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291625
3593	NC_015183	TCG	2	6	187101	187106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291625
3594	NC_015183	CTG	2	6	187175	187180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291625
3595	NC_015183	CGT	2	6	187186	187191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291625
3596	NC_015183	GGT	2	6	187220	187225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291625
3597	NC_015183	GCC	2	6	187280	187285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291625
3598	NC_015183	AAG	2	6	187295	187300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291625
3599	NC_015183	GGAAA	2	10	187305	187314	60 %	0 %	40 %	0 %	325291625
3600	NC_015183	CACATC	2	12	187460	187471	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	325291626
3601	NC_015183	GAA	2	6	187499	187504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291626
3602	NC_015183	ATC	2	6	187533	187538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291626
3603	NC_015183	CTG	2	6	187547	187552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291626
3604	NC_015183	CGC	2	6	187555	187560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291626
3605	NC_015183	CGCC	2	8	187617	187624	0 %	0 %	25 %	75 %	325291626
3606	NC_015183	GGT	2	6	187625	187630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291626
3607	NC_015183	CGA	2	6	187639	187644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291626
3608	NC_015183	TGA	2	6	187671	187676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291626
3609	NC_015183	T	6	6	187700	187705	0 %	100 %	0 %	0 %	325291626
3610	NC_015183	TCG	2	6	187707	187712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291626
3611	NC_015183	GCA	2	6	187973	187978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291627
3612	NC_015183	GCG	2	6	188003	188008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291627
3613	NC_015183	CGG	2	6	188013	188018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291627
3614	NC_015183	T	6	6	188083	188088	0 %	100 %	0 %	0 %	325291627
3615	NC_015183	CGG	2	6	188089	188094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291627
3616	NC_015183	ACC	2	6	188115	188120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291627
3617	NC_015183	GC	3	6	188181	188186	0 %	0 %	50 %	50 %	325291627
3618	NC_015183	CGGG	2	8	188187	188194	0 %	0 %	75 %	25 %	325291627
3619	NC_015183	TCG	2	6	188219	188224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291627
3620	NC_015183	CAT	2	6	188344	188349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291627
3621	NC_015183	GCG	2	6	188367	188372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291627
3622	NC_015183	GCT	2	6	188442	188447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291627
3623	NC_015183	GCC	2	6	188475	188480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291627
3624	NC_015183	CA	3	6	188483	188488	50 %	0 %	0 %	50 %	325291627
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3627	NC_015183	CTT	2	6	188784	188789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291627
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3740	NC_015183	GC	3	6	193742	193747	0 %	0 %	50 %	50 %	325291631
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3742	NC_015183	CGG	2	6	193822	193827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291631
3743	NC_015183	TGA	2	6	193842	193847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291631
3744	NC_015183	CTG	2	6	193877	193882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291631
3745	NC_015183	CTG	2	6	193940	193945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291631
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3764	NC_015183	CAGCGT	2	12	194636	194647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325291631
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3773	NC_015183	TGG	2	6	195168	195173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291632
3774	NC_015183	CGG	2	6	195176	195181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291632
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3801	NC_015183	CG	3	6	196675	196680	0 %	0 %	50 %	50 %	325291633
3802	NC_015183	CGAT	2	8	196687	196694	25 %	25 %	25 %	25 %	325291633
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3846	NC_015183	TCCG	2	8	198893	198900	0 %	25 %	25 %	50 %	325291634
3847	NC_015183	A	6	6	198929	198934	100 %	0 %	0 %	0 %	325291634
3848	NC_015183	CGCTGA	2	12	198968	198979	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325291634
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3851	NC_015183	A	6	6	199226	199231	100 %	0 %	0 %	0 %	325291634
3852	NC_015183	TCC	2	6	199270	199275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291635
3853	NC_015183	GGCGT	2	10	199276	199285	0 %	20 %	60 %	20 %	325291635
3854	NC_015183	ACG	2	6	199300	199305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291635
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3856	NC_015183	CTG	2	6	199396	199401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291635
3857	NC_015183	AGCG	2	8	199434	199441	25 %	0 %	50 %	25 %	325291635
3858	NC_015183	TTC	2	6	199480	199485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291635
3859	NC_015183	ACG	2	6	199501	199506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291635
3860	NC_015183	TCG	2	6	199573	199578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291635
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3862	NC_015183	ACG	2	6	199714	199719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291635
3863	NC_015183	CGA	2	6	199895	199900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291636
3864	NC_015183	TTG	2	6	199930	199935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291636
3865	NC_015183	GAT	2	6	199950	199955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291636
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3982	NC_015183	TGG	2	6	205857	205862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291642
3983	NC_015183	GCCG	2	8	205891	205898	0 %	0 %	50 %	50 %	325291642
3984	NC_015183	GGC	2	6	205946	205951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291642
3985	NC_015183	GAC	2	6	206038	206043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291642
3986	NC_015183	GTG	2	6	206054	206059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291642
3987	NC_015183	GAT	2	6	206185	206190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291642
3988	NC_015183	CAT	2	6	206195	206200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291642
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3991	NC_015183	CAA	2	6	206473	206478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291642
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3993	NC_015183	TGC	2	6	206562	206567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291642
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3999	NC_015183	GCC	2	6	206930	206935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291643
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